Es el área encargada de recibir todos los documentos autorizados para pago y descuento de las diferentes nóminas de la  Universidad Autónoma de Querétaro. Esto, a su vez, se aplica en la quincena o semana que corresponda. Está integrada por su servidora L.A.  M. Elizabeth Zaragoza Puga  (coordinadora del área),  C.P. Thelma Villagrán Rico (secretaria); C. Josefina Robles Luna (encargada de la elaboración de la nómina de base  o quincenal en el rubro de pagos); L.I. Norma Robles Luna (encargada de la elaboración de deducciones en la nómina de base o quincenal, así como también elaboración de la nómina de posgrado y estímulos docentes); L.A.  Mariana Gutiérrez Cárdenas (encargada de la nómina de eventuales y suplentes);  C.P. Inés Zúñiga López (encargada de la nómina de honorarios); C. Norma Sandoval Silva (encargada de nómina de pensión alimenticia y jubilaciones). El equipo de nóminas esta para atenderlos  de las 8:00 a.m. a 15:30 de lunes a viernes.